Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms