Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB4P16144 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms