Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCAP05165 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCAP05165 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCCAP05165 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCCAP05165 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms