Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX58O95786 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX58O95786 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms