Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATBO75879 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATBO75879 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATBO75879 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms