Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBDO15205 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBDO15205 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBDO15205 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBDO15205 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms