Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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