Protein–RNA interactions for Protein: S4R2P9

Slc8a3, Sodium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a3S4R2P9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc8a3S4R2P9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a3S4R2P9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc8a3S4R2P9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc8a3S4R2P9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8a3S4R2P9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8a3S4R2P9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8a3S4R2P9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8a3S4R2P9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8a3S4R2P9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc8a3S4R2P9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms