Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd4Q9Z2D7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd4Q9Z2D7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd4Q9Z2D7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mbd4Q9Z2D7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd4Q9Z2D7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms