Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp4Q9Z1N6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms