Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MthfrQ9WU20 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MthfrQ9WU20 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MthfrQ9WU20 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MthfrQ9WU20 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MthfrQ9WU20 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MthfrQ9WU20 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MthfrQ9WU20 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MthfrQ9WU20 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MthfrQ9WU20 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MthfrQ9WU20 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MthfrQ9WU20 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MthfrQ9WU20 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms