Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTL2

Rab25, Ras-related protein Rab-25, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab25Q9WTL2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab25Q9WTL2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab25Q9WTL2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab25Q9WTL2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab25Q9WTL2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260.8 ms