Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cul3Q9JLV5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul3Q9JLV5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul3Q9JLV5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms