Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR5

Tcf23, Transcription factor 23, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf23Q9JLR5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf23Q9JLR5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcf23Q9JLR5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcf23Q9JLR5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.6 ms