Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm9sf3Q9ET30 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm9sf3Q9ET30 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm9sf3Q9ET30 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm9sf3Q9ET30 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm9sf3Q9ET30 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm9sf3Q9ET30 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tm9sf3Q9ET30 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tm9sf3Q9ET30 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tm9sf3Q9ET30 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm9sf3Q9ET30 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms