Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn10Q9ESK3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn10Q9ESK3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn10Q9ESK3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn10Q9ESK3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn10Q9ESK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn10Q9ESK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms