Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG3

Scel, Sciellin, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScelQ9EQG3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ScelQ9EQG3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ScelQ9EQG3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ScelQ9EQG3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ScelQ9EQG3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScelQ9EQG3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScelQ9EQG3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScelQ9EQG3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScelQ9EQG3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScelQ9EQG3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScelQ9EQG3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScelQ9EQG3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScelQ9EQG3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScelQ9EQG3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScelQ9EQG3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScelQ9EQG3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms