Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif3fQ9DCH4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eif3fQ9DCH4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eif3fQ9DCH4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms