Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sh2d4aQ9D7V1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d4aQ9D7V1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms