Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn22Q9D7U6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn22Q9D7U6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn22Q9D7U6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn22Q9D7U6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms