Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M5

Dynap, Dynactin-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DynapQ9D7M5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DynapQ9D7M5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DynapQ9D7M5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DynapQ9D7M5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DynapQ9D7M5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DynapQ9D7M5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DynapQ9D7M5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DynapQ9D7M5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DynapQ9D7M5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DynapQ9D7M5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DynapQ9D7M5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DynapQ9D7M5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DynapQ9D7M5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DynapQ9D7M5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms