Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K5

Synj2bp, Synaptojanin-2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synj2bpQ9D6K5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synj2bpQ9D6K5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synj2bpQ9D6K5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Synj2bpQ9D6K5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Synj2bpQ9D6K5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms