Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R3

Cep72, Centrosomal protein of 72 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep72Q9D3R3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep72Q9D3R3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep72Q9D3R3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cep72Q9D3R3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep72Q9D3R3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep72Q9D3R3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cep72Q9D3R3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep72Q9D3R3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms