Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P9

Nts, Neurotensin/neuromedin N, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NtsQ9D3P9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NtsQ9D3P9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NtsQ9D3P9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NtsQ9D3P9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NtsQ9D3P9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NtsQ9D3P9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NtsQ9D3P9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NtsQ9D3P9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
NtsQ9D3P9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NtsQ9D3P9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NtsQ9D3P9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NtsQ9D3P9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NtsQ9D3P9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NtsQ9D3P9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2445.3 ms