Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M4

Eef1e1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef1e1Q9D1M4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eef1e1Q9D1M4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eef1e1Q9D1M4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eef1e1Q9D1M4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms