Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SarnpQ9D1J3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SarnpQ9D1J3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SarnpQ9D1J3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SarnpQ9D1J3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SarnpQ9D1J3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SarnpQ9D1J3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SarnpQ9D1J3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SarnpQ9D1J3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SarnpQ9D1J3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SarnpQ9D1J3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms