Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufsp1Q9CZP0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms