Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rpusd4Q9CWX4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpusd4Q9CWX4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms