Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930519P11RikQ9CUJ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930519P11RikQ9CUJ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.5 ms