Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Snw1Q9CSN1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snw1Q9CSN1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snw1Q9CSN1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snw1Q9CSN1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snw1Q9CSN1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms