Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nudt21Q9CQF3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudt21Q9CQF3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudt21Q9CQF3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nudt21Q9CQF3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nudt21Q9CQF3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudt21Q9CQF3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudt21Q9CQF3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudt21Q9CQF3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudt21Q9CQF3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudt21Q9CQF3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudt21Q9CQF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nudt21Q9CQF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms