Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab5aQ9CQD1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab5aQ9CQD1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab5aQ9CQD1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms