Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Ubl4bQ9CQ84 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Ubl4bQ9CQ84 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ubl4bQ9CQ84 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ubl4bQ9CQ84 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ubl4bQ9CQ84 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ubl4bQ9CQ84 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Ubl4bQ9CQ84 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Ubl4bQ9CQ84 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Ubl4bQ9CQ84 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ubl4bQ9CQ84 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ubl4bQ9CQ84 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Ubl4bQ9CQ84 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ubl4bQ9CQ84 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Ubl4bQ9CQ84 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Ubl4bQ9CQ84 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Ubl4bQ9CQ84 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Ubl4bQ9CQ84 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ubl4bQ9CQ84 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Ubl4bQ9CQ84 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Ubl4bQ9CQ84 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Ubl4bQ9CQ84 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Ubl4bQ9CQ84 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ubl4bQ9CQ84 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ubl4bQ9CQ84 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ubl4bQ9CQ84 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ubl4bQ9CQ84 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ubl4bQ9CQ84 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Ubl4bQ9CQ84 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ubl4bQ9CQ84 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Ubl4bQ9CQ84 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ubl4bQ9CQ84 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Ubl4bQ9CQ84 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Ubl4bQ9CQ84 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ubl4bQ9CQ84 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms