Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Commd4Q9CQ02 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Commd4Q9CQ02 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Commd4Q9CQ02 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms