Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU5

Acsbg1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsbg1Q99PU5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Acsbg1Q99PU5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Acsbg1Q99PU5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Acsbg1Q99PU5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Acsbg1Q99PU5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Acsbg1Q99PU5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Acsbg1Q99PU5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms