Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf34Q99KR6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf34Q99KR6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf34Q99KR6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms