Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX4

Eif3m, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3mQ99JX4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eif3mQ99JX4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3mQ99JX4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3mQ99JX4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3mQ99JX4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms