Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrm1Q99J25 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrm1Q99J25 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrm1Q99J25 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms