Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27,27■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
PdgfdQ925I7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27,23■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,22■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
PdgfdQ925I7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27,2■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
PdgfdQ925I7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,12■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,12■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27,1■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
PdgfdQ925I7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
PdgfdQ925I7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
PdgfdQ925I7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,5 ms