Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx15Q91WE1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx15Q91WE1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx15Q91WE1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx15Q91WE1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms