Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Acsl6Q91WC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl6Q91WC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsl6Q91WC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms