Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zkscan3Q91VW9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zkscan3Q91VW9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan3Q91VW9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zkscan3Q91VW9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms