Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHK1

Caskin2, Caskin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin2Q8VHK1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Caskin2Q8VHK1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caskin2Q8VHK1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caskin2Q8VHK1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caskin2Q8VHK1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin2Q8VHK1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin2Q8VHK1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin2Q8VHK1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin2Q8VHK1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin2Q8VHK1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin2Q8VHK1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin2Q8VHK1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin2Q8VHK1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms