Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip5Q8R361 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip5Q8R361 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms