Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MyripQ8K3I4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MyripQ8K3I4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MyripQ8K3I4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MyripQ8K3I4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MyripQ8K3I4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms