Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl47Q8K2Y7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl47Q8K2Y7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms