Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Afg3l2Q8JZQ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Afg3l2Q8JZQ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Afg3l2Q8JZQ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Afg3l2Q8JZQ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Afg3l2Q8JZQ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms