Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC40,88■■■■■ 4,13
Cc2d2aQ8CFW7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40,87■■■■■ 4,13
Cc2d2aQ8CFW7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Cc2d2aQ8CFW7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40,85■■■■■ 4,13
Cc2d2aQ8CFW7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC40,84■■■■■ 4,13
Cc2d2aQ8CFW7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Cc2d2aQ8CFW7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC40,83■■■■■ 4,13
Cc2d2aQ8CFW7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Cc2d2aQ8CFW7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
Cc2d2aQ8CFW7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
Cc2d2aQ8CFW7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Cc2d2aQ8CFW7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Cc2d2aQ8CFW7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Cc2d2aQ8CFW7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Cc2d2aQ8CFW7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Cc2d2aQ8CFW7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC40,77■■■■■ 4,12
Cc2d2aQ8CFW7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC40,76■■■■■ 4,12
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,75■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC40,72■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,71■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC40,7■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Cc2d2aQ8CFW7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC40,69■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC40,69■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC40,68■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC40,67■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,65■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC40,65■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC40,64■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Cc2d2aQ8CFW7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC40,63■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC40,61■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC40,6■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC40,58■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,57■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,57■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Cc2d2aQ8CFW7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,08
Cc2d2aQ8CFW7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Cc2d2aQ8CFW7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
Cc2d2aQ8CFW7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,54■■■■■ 4,08
Cc2d2aQ8CFW7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC40,53■■■■■ 4,08
Cc2d2aQ8CFW7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Cc2d2aQ8CFW7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC40,52■■■■■ 4,08
Cc2d2aQ8CFW7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,5■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC40,5■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,49■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC40,49■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC40,48■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC40,46■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC40,46■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC40,45■■■■■ 4,07
Cc2d2aQ8CFW7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC40,44■■■■■ 4,06
Cc2d2aQ8CFW7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC40,43■■■■■ 4,06
Cc2d2aQ8CFW7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Cc2d2aQ8CFW7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,42■■■■■ 4,06
Cc2d2aQ8CFW7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC40,42■■■■■ 4,06
Cc2d2aQ8CFW7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Cc2d2aQ8CFW7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms