Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vcpip1Q8CDG3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vcpip1Q8CDG3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcpip1Q8CDG3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vcpip1Q8CDG3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms