Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8CC96 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CC96 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CC96 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CC96 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CC96 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CC96 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8CC96 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8CC96 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8CC96 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8CC96 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q8CC96 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CC96 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CC96 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CC96 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CC96 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CC96 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CC96 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CC96 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CC96 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CC96 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CC96 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CC96 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CC96 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CC96 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CC96 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CC96 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CC96 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8CC96 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8CC96 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8CC96 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8CC96 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8CC96 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8CC96 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8CC96 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8CC96 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8CC96 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8CC96 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8CC96 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8CC96 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8CC96 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8CC96 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8CC96 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8CC96 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8CC96 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8CC96 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8CC96 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8CC96 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8CC96 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CC96 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CC96 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CC96 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CC96 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CC96 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CC96 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8CC96 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8CC96 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8CC96 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8CC96 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8CC96 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8CC96 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8CC96 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8CC96 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8CC96 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8CC96 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8CC96 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8CC96 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8CC96 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8CC96 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8CC96 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8CC96 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8CC96 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8CC96 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8CC96 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8CC96 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8CC96 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8CC96 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8CC96 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8CC96 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8CC96 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8CC96 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8CC96 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8CC96 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8CC96 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8CC96 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8CC96 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8CC96 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8CC96 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8CC96 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8CC96 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8CC96 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8CC96 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8CC96 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8CC96 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8CC96 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q8CC96 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8CC96 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8CC96 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8CC96 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8CC96 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms